日本的都、道、府、县是平行的一级行政区，直属中央政府，但各都、道、府、县都拥有自治权。全国分为1都（东京都：Tokyo）、1道（北海道：Hokkaido），2府（大阪府：Osaka、京都府：Kyoto）和43个县（省），下设市、町、村。其办事机构称为“厅”，即“都厅”、“道厅”、“府厅”、“县厅”，行政长官称为“知事”。每个都、道、府、县下设若干个市、町（相当于中国的镇）、村。其办事机构称“役所”，即“市役所”、“町役所”、“村役所”，行政长官称为“市长”、“町长”、“村长”。

北海道地方：北海道（ほっかいどう）

东北地方（とうほくちほう）：青森（あおもり）岩手（いわて）宫城（みやぎ）秋田（あきた）山形（やまがた）福岛（ふくしま）

关东地方（かんとうちほう）：茨城（いばらき）栃木（とちぎ）群马（ぐんま）埼玉（さいたま）千叶（ちば）神奈川（かながわ）东京都（とうきょうと）

中部地方（ちゅうぶちほう）：新泻（にいがた）富山（とやま）石川（いしかわ）福井（ふくい）山梨（やまなし）长野（ながの）岐阜（ぎふ）静冈（しずおか）爱知（あいち）

近畿地方（きんきちほう）：三重（みえ）滋贺（しが）京都府（きょうとふ）大阪府（おおさかふ）兵库（ひょうご）奈良（なら）和歌山（わかやま）

中国四国地方（ちゅうごくしこくちほう）：鸟取（とっとり）岛根（しまね）冈山（おかやま）广岛（ひろしま）山口（やまぐち）徳岛（とくしま）香川（かがわ）爱媛（えひめ）高知（こうち）

九州地方（きゅうしゅうちほう）：福冈（ふくおか）佐贺（さが）长崎（ながさき）熊本（くまもと）大分（おおいた）宫崎（みやざき）鹿儿岛（かごしま）冲绳（おきなわ）

2012年1月23日，日本政府正式决定成立复兴厅，以应对东日本大地震。复兴厅的设置期限为震后10年，即2021年3月底。总部设于东京，并在盛冈、仙台和福岛3市设置统筹支部的“复兴局”。